Alamut Kalesi, Orta Çağ'ın en önemli savunma yapılarından biri olarak bilinse de, 1256 yılında Moğollar tarafından gerçekleştirilen bir saldırıyla tarihe karışmıştır. Hülagu Han liderliğindeki Moğol ordusu, etkili stratejileri ve güçlü askerî gücü ile kaleyi kuşatarak onu ele geçirmiş, böylece tarih sahnesinde önemli bir dönüm noktasını oluşturmuştur. Bu olay, kalenin sadece fiziksel olarak değil, aynı zamanda kültürel ve entelektüel bir mirasın da kaybına yol açmıştır.

Alamut Kalesi, 1256 yılında Moğol hükümdarı Hülagu'nun komutasındaki ordu tarafından yerle bir edilmiştir. Moğol ordusu, kaleye tüneller kazarak patlayıcı ve yanıcı maddeler yerleştirmiş, ardından kaleyi dört gün boyunca bombalamıştır. Mevsim kış olmasına rağmen yerde kar yoktu. Kalenin son komutanı olan Rükneddin Hür Şah, teslim olmuş, ancak daha sonra öldürülmüştür. Alamut Kalesi'nin yıkılmasının ardından, dünyanın en geniş kitap arşivlerinden birine sahip olan Alamut Kütüphanesi'ndeki kitapların büyük kısmının yok olduğu söylenmektedir.