Agamemnon Kaplıcaları, antik tarihin derinliklerine uzanan zengin bir geçmişe sahiptir. MÖ 1200'lerde Truva Savaşı'nın efsanevi lideri Agamemnon'un adını taşıyan bu kaplıcalar, hem efsaneler hem de tarihsel olaylarla doludur. Yüzyıllar boyunca şifa kaynağı olarak kullanılan bu doğal kaynaklar, Roma döneminden Osmanlı İmparatorluğu'na kadar birçok medeniyetin ilgisini çekmiştir. Günümüzde ise, sağlık turizminin önemli bir parçası olarak ziyaretçilerine hizmet vermekte ve geçmişteki şifa geleneğini yaşatmaktadır.

Agamemnon Kaplıcaları'nın tarihi hakkında şu bilgiler verilebilir:

• İlk rivayetler. Kaplıcalara adını veren Agamemnon’a ve MÖ 1200’lü yıllara dayanan rivayetler vardır.
• Truva Savaşı. Truva Savaşı’nın ünlü komutanı Agamemnon’un, yaralı askerlerinin kısa zamanda iyileşip geri döndüğünü görünce kaplıca suyunun şifalı olduğunu keşfettiği söylenir.
• Kızının iyileşmesi. Bir diğer rivayete göre ise Agamemnon’un, yüzü ve vücudu yaralarla kaplı kızının bu sularda yıkanarak iyileşmesi ve güzelleşmesi üzerine, Agamemnon bu yörenin özel bir yer olduğuna inanır.
• Doğu Roma İmparatorluğu. Doğu Roma İmparatorluğu dönemlerinde Hristiyanlığın bedeni hor gören yaklaşımı nedeniyle yıkanma ve vücut temizliği günah sayılmış, bu nedenle kaplıcalar ihmal edilmiş ve harap olmuştur.
• Osmanlı dönemi. 1415 yılında Osmanlılar tarafından İzmir’in alınmasıyla kaplıcalar onarılmış ve tekrar şifa kaynağı haline gelmiştir.
• Cumhuriyet dönemi. Cumhuriyet döneminde yöneticilerin desteğiyle Agamemnon Kaplıcaları giderek gelişmiş, 1980’li yıllarda banyolar ve havuzlar yeniden yapılandırılmış, önce otel bölümü, ardından Tedavi Merkezi açılarak Balçova Termal Tesisleri adıyla sağlık ve turizmin hizmetine sunulmuştur.

Ayrıca, İzmir Dergisi'nde yer alan bir yazıda, kaplıcaların 2500 yıldır şifa dağıttığı belirtilmektedir.