Akvaryum Koyu, doğal güzellikleri ve eşsiz manzarasıyla dikkat çeken bir alan olarak öne çıkıyor. Ancak burada ticari işletmelerin yer almaması, bölgenin korunmasına yönelik uygulamalardan kaynaklanıyor. Doğal sit statüsü, bu bölgenin yapılaşmaya kapalı olmasını sağlarken, yerel yönetimin aldığı önlemler de bu durumu pekiştiriyor.

Akvaryum Koyu'nda ticari işletmelerin bulunmamasının nedeni, doğal sit alanı olması ve çevresinde yapılaşmaya izin verilmemesi dir. Ayrıca, 2023 yılında arsa sahibinin, koya girmek isteyen tatilcilerden ücret talep etmesi üzerine, Bozcaada Belediyesi tarafından ticari faaliyet izinsiz olduğu gerekçesiyle durdurulmuştur.