Agonya Çayı, bölgedeki ekosistem üzerinde önemli bir etkiye sahip olup, tarım faaliyetlerini destekleyen doğal bir kaynak olarak öne çıkmaktadır. Bu çayın varlığı, sulama imkanları ve tarım ürünlerinin çeşitlendirilmesi açısından kritik bir rol oynamaktadır. Özellikle yerel tarımın gelişimi ve yeni ürünlerin entegrasyonu konularında Agonya Çayı'nın sunduğu fırsatlar, çiftçiler için büyük bir avantaj sağlamaktadır. Ancak, çevresel tehditler ve santral projeleri gibi olumsuz unsurların bu dengeyi nasıl etkileyebileceği de dikkatle değerlendirilmelidir.

Agonya Çayı'nın ovaya etkisi genellikle olumlu olarak değerlendirilmektedir. Bu çay, Yenice-Gönen Çayı'nın 1-2 km yanına yapılmak istenen termik santralın külleriyle ve santraldan çıkacak gazların oluşturacağı asit yağmurlarıyla kirlenme riski taşımaktadır. Ancak, devletin bu ovaya yaptığı göletler, arazinin sulanmasını ve tarım ürünlerinin, özellikle kapya biberinin yetiştirilmesini desteklemektedir. Ayrıca, Agonya Ovası'nda aronya gibi yeni ürünlerin yetiştirilmesi de planlanmaktadır. Aronya, şifa deposu olarak bilinen ve bölge için ciddi bir gelir kaynağı olabilecek bir bitkidir. Genel olarak, Agonya Çayı'nın ovaya etkisi, tarım ürünlerinin yetiştirilmesi ve yeni ürünlerin denenmesi açısından olumlu görülürken, termik santralin olası olumsuz etkileri de göz önünde bulundurulmalıdır.