Amida Höyüğü, tarih öncesi dönemlerden başlayarak pek çok medeniyetin izlerini barındıran önemli bir arkeolojik alan olarak bilinir. Bu höyük, insanlık tarihinin derinliklerine kadar uzanan zengin bir geçmişe sahip olup, her dönem farklı kültürlerin buluşma noktası olmuştur. Yapılan kazılar ve araştırmalar, bu tarihi yerleşimin birçok uygarlık tarafından nasıl şekillendirildiğini ve zaman içinde nasıl evrildiğini ortaya koymaktadır.

Amida Höyüğü'nün tarihi, M.Ö. 7000 yılına kadar uzanmaktadır. Höyükte yapılan ilk arkeolojik araştırmalarda, prehistorik dönemden Yeniçağ’a kadar uzanan seramik kap parçaları ve yontma taş aletler bulunmuştur. TÜBİTAK laboratuvarlarında yapılan Karbon-14 analizlerine göre ise höyükte yerleşim M.Ö. 6764 yılına kadar geriye gitmektedir. Amida Höyüğü, tarih boyunca Hurri-Mitanniler, Urartular, Asurlular, Medler, Persler, Büyük Tigran Krallığı, Romalılar, Sasaniler, Bizanslılar, Emeviler, Abbasiler, Mervaniler, Selçuklular, Artuklular, Eyyubiler, Akkoyunlular, Safeviler ve Osmanlılar gibi birçok medeniyetin yerleşim alanı olmuştur. Yerleşimin hiçbir dönem kesintiye uğramadığı, bugüne dek süregelen kazı çalışmaları ve karbon analizleriyle belgelenmiştir.